Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf46Q504U0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf46Q504U0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms