Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETFDHQ16134 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ETFDHQ16134 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms