Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDK3Q15120 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDK3Q15120 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
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