Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB3GAP1Q15042 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
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