Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ODF1Q14990 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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