Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM25Q14258 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM25Q14258 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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