Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms