Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTAN1Q13813 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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