Protein–RNA interactions for Protein: Q13217

DNAJC3, DnaJ homolog subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC3Q13217 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC3Q13217 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DNAJC3Q13217 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DNAJC3Q13217 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DNAJC3Q13217 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DNAJC3Q13217 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DNAJC3Q13217 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC3Q13217 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC3Q13217 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC3Q13217 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC3Q13217 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC3Q13217 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC3Q13217 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC3Q13217 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC3Q13217 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC3Q13217 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC3Q13217 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC3Q13217 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC3Q13217 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DNAJC3Q13217 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms