Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ERCC8Q13216 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms