Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LRP1Q07954 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms