Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLH2Q02577 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLH2Q02577 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms