Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SIM1P81133 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SIM1P81133 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SIM1P81133 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SIM1P81133 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SIM1P81133 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SIM1P81133 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SIM1P81133 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SIM1P81133 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SIM1P81133 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIM1P81133 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIM1P81133 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIM1P81133 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIM1P81133 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIM1P81133 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIM1P81133 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SIM1P81133 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIM1P81133 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIM1P81133 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIM1P81133 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIM1P81133 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SIM1P81133 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIM1P81133 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIM1P81133 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIM1P81133 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIM1P81133 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIM1P81133 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIM1P81133 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIM1P81133 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SIM1P81133 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SIM1P81133 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIM1P81133 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIM1P81133 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIM1P81133 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIM1P81133 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIM1P81133 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIM1P81133 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIM1P81133 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIM1P81133 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIM1P81133 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIM1P81133 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SIM1P81133 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIM1P81133 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIM1P81133 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SIM1P81133 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIM1P81133 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIM1P81133 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIM1P81133 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIM1P81133 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIM1P81133 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIM1P81133 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIM1P81133 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIM1P81133 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SIM1P81133 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIM1P81133 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIM1P81133 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIM1P81133 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIM1P81133 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIM1P81133 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIM1P81133 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIM1P81133 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIM1P81133 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIM1P81133 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIM1P81133 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIM1P81133 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SIM1P81133 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIM1P81133 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SIM1P81133 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIM1P81133 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIM1P81133 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIM1P81133 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIM1P81133 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIM1P81133 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SIM1P81133 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIM1P81133 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SIM1P81133 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms