Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA4AP68366 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms