Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACTA1P68133 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms