Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P61574 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms