Protein–RNA interactions for Protein: P60953

CDC42, Cell division control protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42P60953 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC42P60953 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC42P60953 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC42P60953 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42P60953 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42P60953 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42P60953 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42P60953 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42P60953 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42P60953 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42P60953 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42P60953 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42P60953 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42P60953 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42P60953 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42P60953 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42P60953 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42P60953 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42P60953 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42P60953 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42P60953 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42P60953 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42P60953 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42P60953 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42P60953 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42P60953 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms