Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNB3P54284 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms