Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTCFP49711 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTCFP49711 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTCFP49711 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTCFP49711 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTCFP49711 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTCFP49711 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTCFP49711 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTCFP49711 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTCFP49711 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTCFP49711 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTCFP49711 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTCFP49711 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTCFP49711 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTCFP49711 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTCFP49711 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTCFP49711 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTCFP49711 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTCFP49711 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTCFP49711 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTCFP49711 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTCFP49711 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTCFP49711 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTCFP49711 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTCFP49711 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTCFP49711 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTCFP49711 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTCFP49711 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTCFP49711 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTCFP49711 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTCFP49711 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTCFP49711 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTCFP49711 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTCFP49711 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTCFP49711 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTCFP49711 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTCFP49711 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTCFP49711 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTCFP49711 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTCFP49711 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTCFP49711 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTCFP49711 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTCFP49711 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTCFP49711 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTCFP49711 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTCFP49711 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTCFP49711 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTCFP49711 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTCFP49711 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTCFP49711 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTCFP49711 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTCFP49711 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTCFP49711 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTCFP49711 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTCFP49711 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTCFP49711 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTCFP49711 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTCFP49711 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTCFP49711 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTCFP49711 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTCFP49711 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTCFP49711 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTCFP49711 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTCFP49711 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTCFP49711 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTCFP49711 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTCFP49711 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTCFP49711 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTCFP49711 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTCFP49711 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTCFP49711 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTCFP49711 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTCFP49711 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTCFP49711 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTCFP49711 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTCFP49711 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTCFP49711 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTCFP49711 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTCFP49711 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTCFP49711 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTCFP49711 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTCFP49711 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTCFP49711 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTCFP49711 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTCFP49711 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTCFP49711 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTCFP49711 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTCFP49711 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTCFP49711 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTCFP49711 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTCFP49711 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTCFP49711 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTCFP49711 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTCFP49711 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTCFP49711 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTCFP49711 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTCFP49711 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTCFP49711 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTCFP49711 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTCFP49711 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms