Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3CBP42338 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms