Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms