Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTSSP25774 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTSSP25774 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTSSP25774 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTSSP25774 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTSSP25774 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTSSP25774 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTSSP25774 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTSSP25774 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTSSP25774 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTSSP25774 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTSSP25774 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTSSP25774 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTSSP25774 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTSSP25774 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTSSP25774 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTSSP25774 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTSSP25774 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTSSP25774 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTSSP25774 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTSSP25774 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTSSP25774 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTSSP25774 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTSSP25774 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTSSP25774 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
CTSSP25774 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTSSP25774 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTSSP25774 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms