Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD53P19397 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD53P19397 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD53P19397 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD53P19397 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD53P19397 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD53P19397 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD53P19397 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD53P19397 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD53P19397 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD53P19397 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD53P19397 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD53P19397 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD53P19397 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD53P19397 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD53P19397 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD53P19397 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD53P19397 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD53P19397 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD53P19397 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CD53P19397 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD53P19397 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD53P19397 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD53P19397 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD53P19397 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD53P19397 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD53P19397 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD53P19397 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD53P19397 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD53P19397 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD53P19397 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD53P19397 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD53P19397 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD53P19397 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD53P19397 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD53P19397 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD53P19397 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD53P19397 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms