Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM225BP0DP42 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM225BP0DP42 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms