Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf88P0DMB2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms