Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFMP07197 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFMP07197 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFMP07197 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFMP07197 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFMP07197 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFMP07197 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFMP07197 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFMP07197 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFMP07197 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFMP07197 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFMP07197 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFMP07197 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFMP07197 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFMP07197 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEFMP07197 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFMP07197 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFMP07197 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFMP07197 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFMP07197 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFMP07197 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFMP07197 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFMP07197 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFMP07197 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFMP07197 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFMP07197 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFMP07197 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFMP07197 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFMP07197 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFMP07197 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEFMP07197 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFMP07197 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFMP07197 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFMP07197 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFMP07197 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFMP07197 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFMP07197 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFMP07197 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFMP07197 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFMP07197 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFMP07197 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFMP07197 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFMP07197 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFMP07197 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFMP07197 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFMP07197 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFMP07197 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFMP07197 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFMP07197 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFMP07197 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFMP07197 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFMP07197 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEFMP07197 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFMP07197 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFMP07197 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFMP07197 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFMP07197 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFMP07197 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFMP07197 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFMP07197 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFMP07197 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFMP07197 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFMP07197 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFMP07197 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFMP07197 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFMP07197 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFMP07197 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFMP07197 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFMP07197 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFMP07197 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFMP07197 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEFMP07197 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFMP07197 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFMP07197 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFMP07197 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFMP07197 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFMP07197 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFMP07197 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFMP07197 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFMP07197 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFMP07197 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFMP07197 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFMP07197 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFMP07197 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFMP07197 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFMP07197 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFMP07197 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFMP07197 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFMP07197 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFMP07197 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFMP07197 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFMP07197 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEFMP07197 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFMP07197 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFMP07197 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFMP07197 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFMP07197 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFMP07197 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFMP07197 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEFMP07197 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms