Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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