Protein–RNA interactions for Protein: A0ZSE6

TMEM30CP, Cell cycle control protein 50C, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30CPA0ZSE6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM30CPA0ZSE6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM30CPA0ZSE6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM30CPA0ZSE6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM30CPA0ZSE6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM30CPA0ZSE6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM30CPA0ZSE6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM30CPA0ZSE6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM30CPA0ZSE6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM30CPA0ZSE6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM30CPA0ZSE6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM30CPA0ZSE6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM30CPA0ZSE6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM30CPA0ZSE6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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