Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TCRBV7S3A2A0A539 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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TCRBV7S3A2A0A539 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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TCRBV7S3A2A0A539 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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TCRBV7S3A2A0A539 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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TCRBV7S3A2A0A539 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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TCRBV7S3A2A0A539 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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TCRBV7S3A2A0A539 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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TCRBV7S3A2A0A539 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCRBV7S3A2A0A539 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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TCRBV7S3A2A0A539 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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TCRBV7S3A2A0A539 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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TCRBV7S3A2A0A539 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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TCRBV7S3A2A0A539 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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