Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 PRDM15-202ENST00000398548 6654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 SPATA31D1-201ENST00000344803 4833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 NEK1-206ENST00000510533 5377 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC080128.2-201ENST00000641520 11863 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 COX10-AS1-201ENST00000423323 3000 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 THSD7B-203ENST00000413152 5846 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AKAP2-202ENST00000374525 6866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 TIAM2-203ENST00000360366 5771 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 EFHC1-201ENST00000371068 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 SYNE1-206ENST00000367253 5189 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 MID1-204ENST00000380782 3352 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 MEG3-220ENST00000522771 6984 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 SIK2-201ENST00000304987 9678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 PPP1R3B-201ENST00000310455 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 MBTD1-203ENST00000415868 5099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 RSL1D1-204ENST00000571133 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 RBBP4P4-201ENST00000398588 1289 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC107983.2-201ENST00000425211 4735 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 SLFN13-211ENST00000542635 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 MIAT_exon5_1.1-201ENST00000618919 149 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 SCN10A-201ENST00000449082 6418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 FAM182A-201ENST00000376398 5070 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 SCAF11-202ENST00000369367 7543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 UNC45B-202ENST00000394570 5638 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 GIGYF2-203ENST00000409451 5937 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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