Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 Z99129.4-201ENST00000624649 2435 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 LINC00683-202ENST00000579781 3510 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 WDR19-201ENST00000399820 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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TM4SF4P48230 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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TM4SF4P48230 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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TM4SF4P48230 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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TM4SF4P48230 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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TM4SF4P48230 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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