RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EHMT2Q96KQ7 1210 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FOXD1Q16676 465 aa14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADRA2BP18089 450 aa14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCNA4P22459 653 aa14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.18□□□□□ -0.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NISCHQ9Y2I1 1504 aa14.01□□□□□ -0.17
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CSRNP3Q8WYN3 585 aa13.88□□□□□ -0.19
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa13.24□□□□□ -0.29
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZBTB22O15209 634 aa13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NPM3O75607 178 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MSH5O43196 834 aa12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FOXD4L1Q9NU39 408 aa12.56□□□□□ -0.4
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FKBP8Q14318 412 aa12.42□□□□□ -0.42
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DNAJC5BQ9UF47 199 aa12.28□□□□□ -0.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DMRT2Q9Y5R5 561 aa12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ABCC9O60706 1549 aa12.21□□□□□ -0.45
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa12.16□□□□□ -0.46
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC4A2P04920 1241 aa12.13□□□□□ -0.47
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLCB2Q00722 1185 aa12.08□□□□□ -0.48
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DCAF8L2P0C7V8 631 aa11.99□□□□□ -0.49
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TAOK2Q9UL54 1235 aa11.96□□□□□ -0.5
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATXN8OSP0DMR3 200 aa11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BCANQ96GW7 911 aa11.89□□□□□ -0.51
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TPRNQ4KMQ1 711 aa11.78□□□□□ -0.52
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DCAF8L1A6NGE4 600 aa11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POTEDQ86YR6 584 aa11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VSIG10Q8N0Z9 540 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FBLN2P98095 1184 aa11.61□□□□□ -0.55
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP11.58□□□□□ -0.56
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 PKD2Q13563 968 aa11.51□□□□□ -0.57
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP11.5□□□□□ -0.57
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa11.46□□□□□ -0.58
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VASPP50552 380 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FBXO3Q9UK99 471 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NACADO15069 1562 aa11.42□□□□□ -0.58
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UNC13AQ9UPW8 1703 aa11.39□□□□□ -0.59
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP11.38□□□□□ -0.59
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYO15BQ96JP2 1530 aa11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SCRIBQ14160 1630 aa11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CFAP44Q96MT7 982 aa11.33□□□□□ -0.6
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPDYE4A6NLX3 237 aa11.31□□□□□ -0.6
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARXQ96QS3 562 aa11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PROM2Q8N271 834 aa11.29□□□□□ -0.6
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa11.28□□□□□ -0.6
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa11.27□□□□□ -0.6
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 BICRAQ9NZM4 1560 aa11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
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TRAPPC3L-201ENST00000356128 RGL2O15211 777 aa11.1□□□□□ -0.63
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa11.09□□□□□ -0.63
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RNF39Q9H2S5 420 aa11.07□□□□□ -0.64
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NBR1Q14596 966 aa11.07□□□□□ -0.64
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM132AQ24JP5 1023 aa11.07□□□□□ -0.64
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRHP20396 242 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HOMEZQ8IX15 550 aa11.03□□□□□ -0.64
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POLA2Q14181 598 aa11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CECR2Q9BXF3 1484 aa10.97□□□□□ -0.65
TRAPPC3L-201ENST00000356128 APLP2Q06481 763 aa10.97□□□□□ -0.65
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CAPN15O75808 1086 aa10.96□□□□□ -0.66
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPOCK2Q92563 424 aa10.96□□□□□ -0.66
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa10.95□□□□□ -0.66
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