Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQE9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
U3KQE9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQE9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQE9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQE9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQE9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQE9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQE9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQE9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQE9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQE9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQE9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQE9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQE9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQE9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
U3KQE9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
U3KQE9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
U3KQE9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
U3KQE9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQE9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms