Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHDC2Q9Y2U9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms