Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NRXN1Q9ULB1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NRXN1Q9ULB1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms