Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GGA2Q9UJY4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms