Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN6Q9NWW5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms