Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMCO4Q9NRQ5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms