Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPATA9Q9BWV2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPATA9Q9BWV2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms