Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HIRIP3Q9BW71 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIRIP3Q9BW71 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms