Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECSITQ9BQ95 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECSITQ9BQ95 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms