Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARID3AQ99856 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms