Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKNOX2Q96KN3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms