Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BCANQ96GW7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms