Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms