Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX21Q969T3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms