Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms