Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms