Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYDE1Q6ZW31 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms