Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SAPCD1Q5SSQ6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAPCD1Q5SSQ6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms